Exploring the Crono MA-XRF HDF5 file format

A peek inside

The HDF5 file format is an open self documentable data container file format. It contains Groups and Datasets that can be understood as (sub)folders and files. An excellent python package that can be used to explore and read the contents of an hdf5 file is h5py by Andrew Collette. If you want to read more, the book by Andrew Collette Python and HDF5 - Unlocking scientific data, is an excellent introduction.

Figure 1: An excellent introduction into the HDF5 format

As it turns out, the Crono HDF5 file format is rather complicated are therefore hard to inspect with standard h5py functions. This is due to complicated internal structures of the datasets inside the file. Furthermore, some of the datasets contain binary blobs for which it is still unclear how we can decode them.

The function read_datasets() can be used to obtain a list of all dataset objects for further processing. To inspect the contents of these datasets I have created the functions peek_inside() to inspect the contents of single dataset and report() print an extended summary of the full contents of a Crono HDF5 file.

from cronomaxrf import read_datasets, peek_inside, report

crono_filename = '14200215102021-blindTest2AgedDetail.HDF5'   # 50 Mb 
datasets = read_datasets(crono_filename)

for i, d in enumerate(datasets): 
    print(f'[{i}] {d.name}')

[0] /Configuration/FinalSystemStatus
[1] /Configuration/InitialSystemStatus
[2] /Configuration/Settings
[3] /CreatedDateTime
[4] /CreatedWithSoftwareVersion
[5] /FileStructureVersion
[6] /Images/Documentation
[7] /Images/ImageAdjusting/ImagePixelSizeRatio
[8] /Images/Static
[9] /Images/StitchedImage
[10] /Images/VideoStreams
[11] /XRF/CalibrationPoints
[12] /XRF/DPPStartTimestamp
[13] /XRF/Detected
[14] /XRF/EnergyVector
[15] /XRF/LiveTimes
[16] /XRF/Maps/ComputedMaps
[17] /XRF/MotorsPositions
[18] /XRF/MotorsPositionsStats
[19] /XRF/MotorsTimestamps
[20] /XRF/OutputCountRates
[21] /XRF/ROIs/ROIsEnergies
[22] /XRF/ROIs/ROIsNames
[23] /XRF/ROIs/ROIsObjects
[24] /XRF/RealTimes
[25] /XRF/ResetCounterValue
[26] /XRF/Spectra
[27] /XRF/SpectraIDs
[28] /XRF/SpectraSelectedIndex
[29] /XRF/Timestamps
[30] /XRF/XComputedMapsCoordinate
[31] /XRF/YComputedMapsCoordinate

Below we will need to scroll through quite some data, so let’s just pick one dataset [14] to start to inspect its contents. A dataset can contain attributes and values. Normally attributes are used to store metadata and the values part is used to store the actual measured values…

peek_inside(datasets[14])

/XRF/EnergyVector:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4096,) DTYPE: 'float32'

+VALUES: 
'array([-1.1700948, -1.1581414, -1.146188 , ..., 47.755295 , 47.767246 ,
       47.7792   ], dtype=float32)'

Ok, this dataset /XRF/EnergyVector contains no meta data attributes. It contains a single vector with 4096 floating point numbers. From the context it is clear that these are the energy values in keV units for the detector channels.

Ok, now let’s see the complete contents of the file.

report(crono_filename)

CONTENTS OF CRONO HDF5 FILE: '14200215102021-blindTest2AgedDetail.HDF5'
(32 DATASETS)

[0] /Configuration/FinalSystemStatus
[1] /Configuration/InitialSystemStatus
[2] /Configuration/Settings
[3] /CreatedDateTime
[4] /CreatedWithSoftwareVersion
[5] /FileStructureVersion
[6] /Images/Documentation
[7] /Images/ImageAdjusting/ImagePixelSizeRatio
[8] /Images/Static
[9] /Images/StitchedImage
[10] /Images/VideoStreams
[11] /XRF/CalibrationPoints
[12] /XRF/DPPStartTimestamp
[13] /XRF/Detected
[14] /XRF/EnergyVector
[15] /XRF/LiveTimes
[16] /XRF/Maps/ComputedMaps
[17] /XRF/MotorsPositions
[18] /XRF/MotorsPositionsStats
[19] /XRF/MotorsTimestamps
[20] /XRF/OutputCountRates
[21] /XRF/ROIs/ROIsEnergies
[22] /XRF/ROIs/ROIsNames
[23] /XRF/ROIs/ROIsObjects
[24] /XRF/RealTimes
[25] /XRF/ResetCounterValue
[26] /XRF/Spectra
[27] /XRF/SpectraIDs
[28] /XRF/SpectraSelectedIndex
[29] /XRF/Timestamps
[30] /XRF/XComputedMapsCoordinate
[31] /XRF/YComputedMapsCoordinate

--------------------------------------------------------------------------------
[0] /Configuration/FinalSystemStatus:

+ATTRIBUTES: 
        - DateTime: 10/15/2021 14:27:31
        - TubeTemperature: 57.33

+SHAPE: (1,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(4311,)] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'\x00\x01\x00\x00\x00\xff\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0c\x02\x00\x00\x00Bxglabhwlib, Version=3.2.4.18, Culture=neutral, PublicKeyToken=null\x05\x01\x00\x00\x00 XGLabHWLib.XGLabHWControl+Status\x0b\x00\x00\x00\x05state\x04mode\ndpp_status\x08dpp_info\x13cboardXRaman_status\nccd_status\x0craman_status\x08ccd_info\x0bwaitCounter\rmotors_status\x13dpp_start_timestamp\x04\x04\x04\x04\x04\x04\x04\x04\x00\x04\x00%XGLabHWLib.XGLabHWControl+DeviceState\x02\x00\x00\x00$XGLabHWLib.XGLabHWControl+DeviceMode\x02\x00\x00\x00\x1cXGLabHWLib.DPPLib+DPP_Status\x02\x00\x00\x00\x1aXGLabHWLib.DPPLib+DPP_info\x02\x00\x00\x00.XGLabHWLib.CBoardXRamanLib+CBoardXRamanPackage\x02\x00\x00\x00$XGLabHWLib.XGLabHWControl+CCD_status\x02\x00\x00\x00!XGLabHWLib.CCDLib+detector_status\x02\x00\x00\x00"XGLabHWLib.XGLabHWControl+CCD_info\x02\x00\x00\x00\x08(XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorsStatus\x02\x00\x00\x00\x10\x02\x00\x00\x00\x05\xfd\xff\xff\xff%XGLabHWLib.XGLabHWControl+DeviceState\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x05\xfc\xff\xff\xff$XGLabHWLib.XGLabHWControl+DeviceMode\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x05\xfb\xff\xff\xff\x1cXGLabHWLib.DPPLib+DPP_Status\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x05\xfa\xff\xff\xff\x1aXGLabHWLib.DPPLib+DPP_info\x08\x00\x00\x00\x04name\x0efirmware_major\x0efirmware_minor\x10firmware_release\x02id\x08channels\x0blib_version"timestamps_conv_factor_ticks_to_us\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x0f\x0f\x0f\x0f\x0f\x06\x02\x00\x00\x00\x06\x07\x00\x00\x00\x07SN02432\x02\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x06\x08\x00\x00\x00\x072.4.3.0H\xe1z\x14\xaeG\xe1?\x05\xf7\xff\xff\xff.XGLabHWLib.CBoardXRamanLib+CBoardXRamanPackage;\x00\x00\x00\x05state\x0cflag_LED_RED\x0cflag_EXT_LED\rflag_EXT_LAMP\x15flag_X_TUBE_HV_ENABLE\x11flag_X_TUBE_POWER\x13flag_FILAMENT_READY\rflag_LASER_EN\x0eflag_POWER_SDD\x08flag_FAN\rflag_POWER_5V\x07flag_EV\x0eflag_INTERLOCK\x12flag_SERVO_COLL_EN\x14flag_SERVO_FILTER_EN\x12flag_reset_sw_flag\x0cflag_PC_SHDW\x0fflag_EXTLAMP_OK\x0eflag_ALARM_OUT\rflag_ALARM_IN\x11flag_ALARM_OUT_EN\x11flag_LIGHT_RED_ON\x13flag_LIGHT_GREEN_ON\x12flag_LIGHT_BLUE_ON\x13flag_LIGHT_WHITE_ON\x10flag_LIGHT_IR_ON\x10flag_LIGHT_UV_ON\x0fflag_LASER_1_ON\x0fflag_LASER_2_ON\x0eflag_BUZZER_ON\x0cflag_SHDW_ON\tTPM_value\x08HM_value\x0cMON_5V_value\rMON_12V_value\x0fX_TUBE_HV_value\x11X_TUBE_CURR_value\x10MON_5V_USB_value\x0eSDD_TEMP_value\x0cSDD_HV_value\x14CURR_12V_SENSE_value\x0efirm_maj_value\x0efirm_min_value\x0efirm_sub_value\rled_red_Value\x0eEXT_TEMP_value\x0eflag_DPP_POWER\x0fflag_LIGHT_1_ON\x0fflag_LIGHT_2_ON\x17flag_TUBE_BUZZER_ENABLE\x11flag_MOTOR_REJECT\x12flag_MOTOR_WARNING\x15flag_MOTOR_WAIT_REPLY\x14flag_MOTOR_REPLY_RDY\x13flag_MOTOR_X_MOVING\x13flag_MOTOR_Y_MOVING\x13flag_MOTOR_Z_MOVING\x0eflag_DPP_START\x0cflag_DPP_EOL\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-XGLabHWLib.CBoardXRamanLib+CBoardXRamanStatus\x02\x00\x00\x00\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x02\x02\x02\x01\x06\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x01\x02\x00\x00\x00\x05\xf6\xff\xff\xff-XGLabHWLib.CBoardXRamanLib+CBoardXRamanStatus\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x01\x01\x01\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80=\xaaL@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xecQ\xb8\x1e\xc5E\xb3@\x00\x00\x00\x00\x00*\xc7@\xc5\xea\x8f0\x0c\xd8\xe5?\x1a\xa8\x8c\x7f\x9fq\xb9\xbf\xcd\xcc\xcc\xcc\xcc\xcc\x1f@\xd7\xa3p=\ngC\xc0\xed\x9e<,\xd4\x88c\xc0\x00\x00\x00\x00\x00V\xa3@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xfe\xaf@\x01\x00\x01\x00\x01\x01\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xf5\xff\xff\xff$XGLabHWLib.XGLabHWControl+CCD_status\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xf4\xff\xff\xff!XGLabHWLib.CCDLib+detector_status\t\x00\x00\x00\x07present\x07enabled\x07running\x19required_integration_time\x15required_acquisitions\x18elapsed_integration_time\x14elapsed_acquisitions\x13exposed_acquisition\x10sum_acquisitions\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x01\x01\x0f\x0f\x0f\x0f\x0f\x01\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xf3\xff\xff\xff"XGLabHWLib.XGLabHWControl+CCD_info\x0f\x00\x00\x00\x06serial\x04name\ndet_number\ndev_number\rversion_major\rversion_minor\rversion_build\x08dna_high\x07dna_low\x14laserCaseTemperature\x15laserPhotodiodeOutput\x0epeltierCurrent\x0emonitorVoltage\x0claserCurrent\x0eccdTemperature\x03\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x19System.Text.StringBuilder\x19System.Text.StringBuilder\x0f\x0f\x0f\x0f\x0f\x0f\x0f\x06\x06\x06\x06\x06\x06\x02\x00\x00\x00\t\x0e\x00\x00\x00\t\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\n\x00\x00\x00\x05\xf0\xff\xff\xff(XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorsStatus\x03\x00\x00\x00\x07X_motor\x07Y_motor\x07Z_motor\x04\x04\x04\'XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorStatus\x02\x00\x00\x00\'XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorStatus\x02\x00\x00\x00\'XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorStatus\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x05\xef\xff\xff\xff\'XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorStatus\x07\x00\x00\x00\x05state\x08Position\x06Moving\tHomeState\x04info\nlockedAxis\x0elockedJoystick\x04\x00\x04\x04\x04\x00\x00,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorsConnection\x02\x00\x00\x00\x08,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorMovingState\x02\x00\x00\x00*XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorHomeState\x02\x00\x00\x00,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorInformation\x02\x00\x00\x00\x01\x01\x02\x00\x00\x00\x05\xee\xff\xff\xff,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorsConnection\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\xec+\x1a\x00\x05\xed\xff\xff\xff,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorMovingState\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xec\xff\xff\xff*XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorHomeState\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x05\xeb\xff\xff\xff,XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorInformation\x03\x00\x00\x00\x0eFirmware_Major\x0eFirmware_Minor\tDevice_ID\x00\x00\x00\x08\x08\x08\x02\x00\x00\x00\x07\x00\x00\x00\r\x00\x00\x00\x0ev\x00\x00\x00\x01\x01\xea\xff\xff\xff\xef\xff\xff\xff\x01\xe9\xff\xff\xff\xee\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\xca\xa7\x17\x00\x01\xe8\xff\xff\xff\xed\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x01\xe7\xff\xff\xff\xec\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\x01\xe6\xff\xff\xff\xeb\xff\xff\xff\x07\x00\x00\x00\r\x00\x00\x00\x0ev\x00\x00\x00\x01\x01\xe5\xff\xff\xff\xef\xff\xff\xff\x01\xe4\xff\xff\xff\xee\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\xbd\x13\x07\x00\x01\xe3\xff\xff\xff\xed\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x01\xe2\xff\xff\xff\xec\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\x01\xe1\xff\xff\xff\xeb\xff\xff\xff\x07\x00\x00\x00\r\x00\x00\x00\x0ev\x00\x00\x01\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x04\x0e\x00\x00\x00\x19System.Text.StringBuilder\x04\x00\x00\x00\rm_MaxCapacity\x08Capacity\rm_StringValue\x0fm_currentThread\x00\x00\x01\x00\x08\x08\x08\xff\xff\xff\x7f\x10\x00\x00\x00\x06 \x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x0f\x00\x00\x00\x0e\x00\x00\x00\xff\xff\xff\x7f\x10\x00\x00\x00\t \x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0b''


--------------------------------------------------------------------------------
[1] /Configuration/InitialSystemStatus:

+ATTRIBUTES: 
        - DateTime: 10/15/2021 14:20:06
        - TubeTemperature: 57.33

+SHAPE: (1,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(4311,)] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'\x00\x01\x00\x00\x00\xff\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0c\x02\x00\x00\x00Bxglabhwlib, Version=3.2.4.18, Culture=neutral, PublicKeyToken=null\x05\x01\x00\x00\x00 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Linear 600 mm\x03\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x05\xf5\xff\xff\xff%XGLabHWLib.MotorsLibClasses.MotorType\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x95\n\x00\xe8\x03\x00\x00ffffff\xb9?\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xf4\xff\xff\xff\xf8\xff\xff\xff\x01\x01\xf3\xff\xff\xff\xf7\xff\xff\xff\x06\x0e\x00\x00\x00\x16Standard Linear 450 mm\x01\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x01\x01\xf1\xff\xff\xff\xf5\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xb5Z\r\x00\xe8\x03\x00\x00ffffff\xb9?\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xf0\xff\xff\xff\xf8\xff\xff\xff\x01\x01\xef\xff\xff\xff\xf7\xff\xff\xff\x06\x12\x00\x00\x00\x16Standard Linear 075 mm\x03\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x01\xed\xff\xff\xff\xf5\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xb5Z\r\x00\xe8\x03\x00\x00ffffff\xb9?\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xec\xff\xff\xff-XGLabHWLib.XGLabHWControl+CalibrationSettings\t\x00\x00\x00\x0ecalib_p1_count\x0fcalib_p1_energy\x0ecalib_p2_count\x0fcalib_p2_energy\x0ccalib_counts\x0ecalib_energies\x0ecalib_channels\ncalib_mode\x0ecalib_equation\x00\x00\x00\x00\x07\x07\x00\x00\x00\x0b\x0b\x0b\x0b\x0b\x0b\x08\x08\x08\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x15\x00\x00\x00\t\x16\x00\x00\x00\x00\x10\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xe9\xff\xff\xff\xec\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x18\x00\x00\x00\t\x19\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xe6\xff\xff\xff*XGLabHWLib.XGLabHWControl+ControlsSettings\x05\x00\x00\x00"limit_factor_single_spectra_enable\x1blimit_factor_mapping_enable\x12limit_factor_alert\x0climit_factor\x12tube_buzzer_enable\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x01\x08\x06\x01\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00333333\xc3?\x00-\x00\x00\x00\x0f\x15\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x0b\x00\xc0@D\x00\x00\xf4D\x0f\x16\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x0bj\xbc\x00A\xd3M\xb1A\x0f\x18\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x0b\x00\x00zC\x00\x00\x0cD\x0f\x19\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x0b\x00\x80\x8cC\x00\xe0\x87D\x0b''


--------------------------------------------------------------------------------
[3] /CreatedDateTime:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (50,) DTYPE: '|S1'

+VALUES: 
'10/15/2021 14:20:02'


--------------------------------------------------------------------------------
[4] /CreatedWithSoftwareVersion:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (50,) DTYPE: '|S1'

+VALUES: 
'CRONO 1.2.4.54'


--------------------------------------------------------------------------------
[5] /FileStructureVersion:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (2,) DTYPE: 'int32'

+VALUES: 
'array([1, 6], dtype=int32)'


--------------------------------------------------------------------------------
[6] /Images/Documentation:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (1,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(0,)] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'''


--------------------------------------------------------------------------------
[7] /Images/ImageAdjusting/ImagePixelSizeRatio:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (1, 2) DTYPE: 'float32'

+VALUES: 
'array([[11.085714, 11.085714]], dtype=float32)'


--------------------------------------------------------------------------------

[8] /Images/Static:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (13358,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(0,), (2565,), (2572,), (2525,), '....'] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'''


--------------------------------------------------------------------------------
[9] /Images/StitchedImage:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (1,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(0,)] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'''


--------------------------------------------------------------------------------
[10] /Images/VideoStreams:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (1,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(0,)] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'''


--------------------------------------------------------------------------------
[11] /XRF/CalibrationPoints:

+ATTRIBUTES: 
        - CalibrationBins: 4096
        - CalibrationEquation: 0

+SHAPE: (2, 2) DTYPE: 'float32'

+VALUES: 
'array([[ 771.   ,    8.046],
       [1952.   ,   22.163]], dtype=float32)'


--------------------------------------------------------------------------------
[12] /XRF/DPPStartTimestamp:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([125903380430, 125903380430, 125903380430, ..., 125903380430,
       125903380430, 125903380430], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[13] /XRF/Detected:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint32'

+VALUES: 
'array([515, 578, 567, ..., 635, 603, 622], dtype=uint32)'


--------------------------------------------------------------------------------
[14] /XRF/EnergyVector:

+ATTRIBUTES: (none)

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+VALUES: 
'array([-1.1700948, -1.1581414, -1.146188 , ..., 47.755295 , 47.767246 ,
       47.7792   ], dtype=float32)'


--------------------------------------------------------------------------------
[15] /XRF/LiveTimes:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([59436, 59356, 59368, ..., 59300, 59336, 59316], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[16] /XRF/Maps/ComputedMaps:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (85, 37, 27) DTYPE: 'float64'

+VALUES: 
'array([[[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]],

       [[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]],

       [[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]],

       ...,

       [[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]],

       [[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]],

       [[nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        ...,
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan],
        [nan, nan, nan, ..., nan, nan, nan]]])'


--------------------------------------------------------------------------------
[17] /XRF/MotorsPositions:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284, 3) DTYPE: 'uint32'

+VALUES: 
'array([[132252, 111816,  46018],
       [132252, 111816,  46018],
       [132273, 111816,  46018],
       ...,
       [169155, 153817,  46018],
       [169832, 153817,  46018],
       [170151, 153817,  46018]], dtype=uint32)'


--------------------------------------------------------------------------------
[18] /XRF/MotorsPositionsStats:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint8'

+VALUES: 
'array([1, 1, 1, ..., 1, 1, 1], dtype=uint8)'


--------------------------------------------------------------------------------
[19] /XRF/MotorsTimestamps:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284, 3) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([[ 8479, 11082, 13794],
       [ 8479, 11082, 13794],
       [ 8480, 11079, 13791],
       ...,
       [ 8597, 11195, 13809],
       [ 8594, 11195, 13809],
       [ 8596, 11199, 13810]], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[20] /XRF/OutputCountRates:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'float64'

+VALUES: 
'array([ 9.38333333, 10.31666667, 10.15      , ..., 11.25      ,
       10.76666667, 11.11666667])'


--------------------------------------------------------------------------------
[21] /XRF/ROIs/ROIsEnergies:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (27, 2) DTYPE: 'float64'

+VALUES: 
'array([[ 1.6389612 ,  1.88998318],
       [ 2.18881893,  2.39202714],
       [ 3.51564956,  3.85034561],
       [ 4.29262257,  4.65122557],
       [ 5.05764198,  5.30866432],
       [ 5.30866432,  5.61945343],
       [ 5.69117403,  6.04977655],
       [ 6.16931105,  6.611588  ],
       [ 6.77893591,  7.24511957],
       [ 7.54920769,  7.54920769],
       [ 8.36874199,  8.87078571],
       [10.35301113, 10.81919479],
       [12.4209547 , 12.86323166],
       [13.90318012, 14.45303822],
       [18.20641518, 19.48980331],
       [ 3.1809535 ,  3.4678359 ],
       [11.7412138 , 12.09821224],
       [ 9.80000019, 10.10000038],
       [11.01045036, 11.46468067],
       [22.85629845, 23.54959869],
       [16.92739868, 17.57288361],
       [14.58452606, 14.95508194],
       [19.83208084, 20.5731945 ],
       [ 1.86607635,  2.12905169],
       [ 7.31684017,  7.65153646],
       [ 8.9664135 ,  9.43259716],
       [24.81232262, 25.71306229]])'


--------------------------------------------------------------------------------
[22] /XRF/ROIs/ROIsNames:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (27,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(4,), (3,), (4,), (8,), '....'] SUB_DTYPE: '|S1'

+VALUES: 
'SiKa
SKa
CaKa
TiKaBaLa
BaLg
CrKaBaLl
MnKa
FeKa
FeKbCoKa
CuKa
ZnKa
PbLa
PbLb
SrKa
Compton
KKa
AsKb
HgLa
SeKa
CdKa
New ROI (1)
New ROI (2)
RhKa
PKa
NiKa
New ROI (3)
SnKa'


--------------------------------------------------------------------------------
[23] /XRF/ROIs/ROIsObjects:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (27,) DTYPE: 'object' SUBSHAPES: [(2138,), (2136,), (2138,), (2142,), '....'] SUB_DTYPE: '|V1'

+VALUES: 
'b'\x00\x01\x00\x00\x00\xff\xff\xff\xff\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0c\x02\x00\x00\x00GXGLabMappingLib, Version=1.2.4.45, Culture=neutral, PublicKeyToken=null\x05\x01\x00\x00\x00$XGLabMappingLib.ObservableROIWrapper\x01\x00\x00\x00\x04_roi\x04\x13XGLabMappingLib.ROI\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\t\x03\x00\x00\x00\x05\x03\x00\x00\x00\x13XGLabMappingLib.ROI\x08\x00\x00\x00\x15<name>k__BackingField\x18<element>k__BackingField\x1b<definition>k__BackingField\x15<type>k__BackingField\x16<start>k__BackingField\x14<end>k__BackingField\x18<palette>k__BackingField\x19<editable>k__BackingField\x01\x01\x04\x04\x00\x00\x04\x00\x1dXGLabMappingLib.ROIDefinition\x02\x00\x00\x00\x1fXGLabMappingLib.ROIAnalysisType\x02\x00\x00\x00\x05\x05\x17XGLabMappingLib.Palette\x02\x00\x00\x00\x01\x02\x00\x00\x00\x06\x04\x00\x00\x00\x04SiKa\x06\x05\x00\x00\x00\x00\x05\xfa\xff\xff\xff\x1dXGLabMappingLib.ROIDefinition\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xf9\xff\xff\xff\x1fXGLabMappingLib.ROIAnalysisType\x01\x00\x00\x00\x07value__\x00\x08\x02\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x101.63896119594574\x101.88998317718506\t\x08\x00\x00\x00\x01\x05\x08\x00\x00\x00\x17XGLabMappingLib.Palette\x03\x00\x00\x00\x0b_colorSteps\x1b<autoMaxMin>k__BackingField\x17<smooth>k__BackingField\x04\x00\x00\x1cXGLabMappingLib.PaletteSteps\x02\x00\x00\x00\x01\x01\x02\x00\x00\x00\t\t\x00\x00\x00\x01\x01\x05\t\x00\x00\x00\x1cXGLabMappingLib.PaletteSteps\x01\x00\x00\x00\x06_steps\x03\x89\x01System.Collections.Generic.List`1[[XGLabMappingLib.PaletteStep, XGLabMappingLib, Version=1.2.4.45, Culture=neutral, PublicKeyToken=null]]\x02\x00\x00\x00\t\n\x00\x00\x00\x04\n\x00\x00\x00\x89\x01System.Collections.Generic.List`1[[XGLabMappingLib.PaletteStep, XGLabMappingLib, Version=1.2.4.45, Culture=neutral, PublicKeyToken=null]]\x03\x00\x00\x00\x06_items\x05_size\x08_version\x04\x00\x00\x1dXGLabMappingLib.PaletteStep[]\x02\x00\x00\x00\x08\x08\t\x0b\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x07\x0b\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x10\x00\x00\x00\x04\x1bXGLabMappingLib.PaletteStep\x02\x00\x00\x00\x0c\r\x00\x00\x00QSystem.Drawing, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b03f5f7f11d50a3a\x05\xf4\xff\xff\xff\x1bXGLabMappingLib.PaletteStep\x02\x00\x00\x00\x05value\x05color\x00\x04\x06\x14System.Drawing.Color\r\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\xf2\xff\xff\xff\x14System.Drawing.Color\x04\x00\x00\x00\x04name\x05value\nknownColor\x05state\x01\x00\x00\x00\t\x07\x07\r\x00\x00\x00\n@\x00@\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xf1\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00@o@\x01\xf0\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x80\x00\x80\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xef\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00@\x7f@\x01\xee\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\xeeh{\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xed\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00p\x87@\x01\xec\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\xed\x95d\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xeb\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00@\x8f@\x01\xea\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n2\xcd2\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xe9\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x88\x93@\x01\xe8\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x90\xee\x90\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xe7\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00p\x97@\x01\xe6\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xe5\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00X\x9b@\x01\xe4\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\xa5\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xe3\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00@\x9f@\x01\xe2\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x01\xe1\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xe0\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xdf\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xde\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xdd\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xdc\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xdb\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xda\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd9\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd8\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd7\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd6\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd5\xff\xff\xff\xf4\xff\xff\xff\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\xd4\xff\xff\xff\xf2\xff\xff\xff\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0b''


--------------------------------------------------------------------------------
[24] /XRF/RealTimes:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([60000, 60000, 60000, ..., 60000, 60000, 60000], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[25] /XRF/ResetCounterValue:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint32'

+VALUES: 
'array([ 9, 11, 11, ..., 11, 11, 11], dtype=uint32)'


--------------------------------------------------------------------------------

[26] /XRF/Spectra:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284, 4096) DTYPE: 'uint16'

+VALUES: 
'array([[0, 0, 0, ..., 0, 0, 0],
       [0, 0, 0, ..., 0, 0, 0],
       [0, 0, 0, ..., 0, 0, 0],
       ...,
       [0, 0, 0, ..., 0, 0, 0],
       [0, 0, 0, ..., 0, 0, 0],
       [0, 0, 0, ..., 0, 0, 0]], dtype=uint16)'


--------------------------------------------------------------------------------
[27] /XRF/SpectraIDs:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint16'

+VALUES: 
'array([20518, 20519, 20520, ..., 27568, 27569, 27570], dtype=uint16)'


--------------------------------------------------------------------------------
[28] /XRF/SpectraSelectedIndex:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (85, 37, 1) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([[[   4],
        [   5],
        [   6],
        ...,
        [  44],
        [  45],
        [  47]],

       [[  97],
        [  96],
        [  95],
        ...,
        [  56],
        [  55],
        [  54]],

       [[ 104],
        [ 106],
        [ 107],
        ...,
        [ 145],
        [ 146],
        [ 147]],

       ...,

       [[4136],
        [4138],
        [4139],
        ...,
        [4177],
        [4178],
        [4180]],

       [[4230],
        [4228],
        [4227],
        ...,
        [4189],
        [4187],
        [4186]],

       [[4237],
        [4239],
        [4240],
        ...,
        [4278],
        [4279],
        [4281]]], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[29] /XRF/Timestamps:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (4284,) DTYPE: 'uint64'

+VALUES: 
'array([ 14880000,  14940000,  15000000, ..., 437880000, 437940000,
       438000000], dtype=uint64)'


--------------------------------------------------------------------------------
[30] /XRF/XComputedMapsCoordinate:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (85, 37, 1) DTYPE: 'float64'

+VALUES: 
'array([[[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       ...,

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]]])'


--------------------------------------------------------------------------------
[31] /XRF/YComputedMapsCoordinate:

+ATTRIBUTES: (none)

+SHAPE: (85, 37, 1) DTYPE: 'float64'

+VALUES: 
'array([[[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       ...,

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
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        [nan]],

       [[nan],
        [nan],
        [nan],
        ...,
        [nan],
        [nan],
        [nan]]])'

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